Kodomo

User

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Задания

  1. (0.5) Скрипт получает на вход текстовый файл (любой текст), читает его, заменяет все точки на восклицательные знаки и записывает в другой файл.

  2. (1 балл): Скрипт получает на вход два файла. В одном ids.txt друг под другом указаны id-шники SwissProt белков, а во втором находится фрагмент банка SwissProt (6MB) в формате Stockholm. Нужно выбрать из файла с банком SwissProt последовательности для id-шников, которые перечислены в первом файле, и напечатать файл в fasta-формате

  3. (2 балла): Скрипт на вход получает имя файла с банком SwissProt и ID-шник белка. После этого печатает на экран информацию о данном белке:

    • Accession number – поле AC
    • Организм – поле OS
    • Описание белка – поле DE
    • Ключевые слова – поле KW
    • Длину белка
    • Последовательность белка (без пробелов)

2012/4/Python/8/Task (last edited 2014-03-31 05:50:08 by stavrovskaya)